 转基因技术显著的提高了农作物的品质和产量，因而得到了迅速的推广，并且成为目前普遍应用的良种培育技术。到2000年，全世界转基因农作物的种植面积已经达到4420万公顷，其中，大豆占58%；玉米占23%%；棉花占12%。在全球转基因作物的总产量中，美国占68%。
转基因作物从一出世就引起了激烈的争论。反对者从食品安全、基因扩散、生态失衡等角度提出了反对意见；而造成者也言之有据地一一加以反驳。关于转基因食品利弊的争论还在持续，尚无结论。至少目前还没有充分的证据说明转基因作物及食品会导致危害人体、动物、植物及危害生态环境的后果，也没有一例消费者因食用转基因食品而导致健康损害的报告。
 
2001年9月，世界卫生组织和联合国粮农组织宣布：联合国食品法典委员会已经制定了评估转基因食品是否符合健康标准的首批原则。在日内瓦召开的第24届食品法典委员会大会决定，转基因食品在推向市场前，必须经过政府的检验和批准。我国生物安全研究项目已开始启动，国家制定的《农业转基因生物安全管理条例》等有关法规也已经出台。
联合国《生物安全议定书》指出，各国公众都有权利知道转基因食品的真实情况，并可以自愿进行选择。国际消费者联合会向联合国食品委员会建议：转基因食品应有标识，让消费者明明白白地知道食品是否含有转基因，由他们自己决定是否选择这类食品。
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